Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptprn2P80560 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptprn2P80560 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptprn2P80560 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms