Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vamp7P70280 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vamp7P70280 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms