Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Surf6P70279 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Surf6P70279 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Surf6P70279 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Surf6P70279 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Surf6P70279 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Surf6P70279 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Surf6P70279 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Surf6P70279 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Surf6P70279 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Surf6P70279 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf6P70279 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf6P70279 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Surf6P70279 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Surf6P70279 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Surf6P70279 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms