Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chl1P70232 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chl1P70232 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chl1P70232 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chl1P70232 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chl1P70232 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Chl1P70232 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chl1P70232 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Chl1P70232 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chl1P70232 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chl1P70232 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chl1P70232 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms