Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Crip1P63254 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Crip1P63254 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Crip1P63254 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crip1P63254 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crip1P63254 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crip1P63254 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crip1P63254 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms