Protein–RNA interactions for Protein: P62334

Psmc6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc6P62334 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Psmc6P62334 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Psmc6P62334 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psmc6P62334 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psmc6P62334 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psmc6P62334 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psmc6P62334 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psmc6P62334 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc6P62334 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc6P62334 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc6P62334 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc6P62334 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc6P62334 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc6P62334 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc6P62334 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psmc6P62334 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psmc6P62334 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmc6P62334 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmc6P62334 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmc6P62334 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psmc6P62334 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmc6P62334 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Psmc6P62334 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmc6P62334 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmc6P62334 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmc6P62334 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmc6P62334 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmc6P62334 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmc6P62334 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmc6P62334 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms