Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Senp1P59110 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Senp1P59110 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Senp1P59110 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Senp1P59110 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Senp1P59110 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Senp1P59110 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Senp1P59110 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Senp1P59110 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Senp1P59110 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Senp1P59110 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Senp1P59110 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Senp1P59110 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Senp1P59110 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Senp1P59110 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Senp1P59110 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Senp1P59110 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Senp1P59110 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Senp1P59110 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Senp1P59110 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Senp1P59110 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Senp1P59110 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Senp1P59110 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Senp1P59110 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms