Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lhx3P50481 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lhx3P50481 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms