Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cox8bP48772 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox8bP48772 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox8bP48772 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms