Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpn11P35235 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpn11P35235 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptpn11P35235 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptpn11P35235 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptpn11P35235 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptpn11P35235 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptpn11P35235 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptpn11P35235 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptpn11P35235 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptpn11P35235 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptpn11P35235 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptpn11P35235 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptpn11P35235 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptpn11P35235 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptpn11P35235 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ptpn11P35235 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn11P35235 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.8 ms