Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Aco1P28271 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Aco1P28271 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Aco1P28271 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Aco1P28271 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Aco1P28271 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Aco1P28271 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Aco1P28271 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Aco1P28271 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Aco1P28271 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Aco1P28271 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Aco1P28271 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms