Protein–RNA interactions for Protein: P21995

Emb, Embigin, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EmbP21995 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EmbP21995 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EmbP21995 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EmbP21995 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EmbP21995 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EmbP21995 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EmbP21995 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EmbP21995 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EmbP21995 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EmbP21995 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EmbP21995 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EmbP21995 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EmbP21995 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EmbP21995 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EmbP21995 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EmbP21995 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EmbP21995 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EmbP21995 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EmbP21995 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EmbP21995 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EmbP21995 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EmbP21995 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EmbP21995 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EmbP21995 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EmbP21995 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EmbP21995 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EmbP21995 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EmbP21995 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EmbP21995 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EmbP21995 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EmbP21995 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EmbP21995 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EmbP21995 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EmbP21995 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EmbP21995 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EmbP21995 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EmbP21995 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EmbP21995 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EmbP21995 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EmbP21995 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EmbP21995 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EmbP21995 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EmbP21995 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EmbP21995 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EmbP21995 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EmbP21995 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EmbP21995 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EmbP21995 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EmbP21995 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EmbP21995 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EmbP21995 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EmbP21995 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EmbP21995 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EmbP21995 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EmbP21995 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EmbP21995 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EmbP21995 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EmbP21995 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EmbP21995 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EmbP21995 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EmbP21995 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EmbP21995 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EmbP21995 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EmbP21995 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EmbP21995 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EmbP21995 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EmbP21995 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EmbP21995 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EmbP21995 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EmbP21995 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EmbP21995 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EmbP21995 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EmbP21995 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EmbP21995 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EmbP21995 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EmbP21995 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EmbP21995 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EmbP21995 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EmbP21995 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EmbP21995 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EmbP21995 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EmbP21995 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EmbP21995 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EmbP21995 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EmbP21995 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EmbP21995 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EmbP21995 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EmbP21995 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EmbP21995 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EmbP21995 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EmbP21995 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EmbP21995 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EmbP21995 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EmbP21995 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EmbP21995 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EmbP21995 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EmbP21995 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EmbP21995 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EmbP21995 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EmbP21995 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms