Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou3f1P21952 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou3f1P21952 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pou3f1P21952 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou3f1P21952 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms