Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18527 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18527 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18527 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18527 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18527 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18527 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18527 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P18527 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P18527 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18527 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18527 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18527 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18527 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18527 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18527 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18527 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18527 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18527 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18527 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18527 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18527 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18527 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18527 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18527 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P18527 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18527 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18527 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18527 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18527 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18527 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18527 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18527 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18527 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18527 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18527 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18527 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18527 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18527 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P18527 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18527 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18527 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18527 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18527 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18527 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18527 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18527 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18527 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18527 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18527 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18527 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18527 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18527 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18527 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18527 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18527 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18527 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18527 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P18527 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18527 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18527 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18527 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18527 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18527 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18527 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18527 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18527 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18527 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18527 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18527 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18527 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18527 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18527 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18527 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18527 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18527 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18527 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18527 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18527 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18527 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18527 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18527 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18527 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18527 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18527 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18527 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18527 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18527 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18527 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18527 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18527 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18527 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18527 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18527 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18527 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P18527 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P18527 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18527 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18527 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18527 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms