Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChgbP16014 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChgbP16014 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgbP16014 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgbP16014 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChgbP16014 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChgbP16014 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgbP16014 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgbP16014 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgbP16014 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChgbP16014 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChgbP16014 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChgbP16014 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms