Protein–RNA interactions for Protein: P0C0A3

Chmp6, Charged multivesicular body protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp6P0C0A3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp6P0C0A3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp6P0C0A3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp6P0C0A3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms