Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gap43P06837 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gap43P06837 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gap43P06837 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gap43P06837 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gap43P06837 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gap43P06837 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gap43P06837 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gap43P06837 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gap43P06837 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gap43P06837 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gap43P06837 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gap43P06837 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gap43P06837 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gap43P06837 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gap43P06837 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gap43P06837 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gap43P06837 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gap43P06837 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gap43P06837 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gap43P06837 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gap43P06837 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gap43P06837 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gap43P06837 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gap43P06837 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gap43P06837 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gap43P06837 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gap43P06837 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gap43P06837 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gap43P06837 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gap43P06837 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gap43P06837 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gap43P06837 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gap43P06837 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gap43P06837 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gap43P06837 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gap43P06837 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gap43P06837 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gap43P06837 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gap43P06837 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gap43P06837 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gap43P06837 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gap43P06837 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gap43P06837 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gap43P06837 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gap43P06837 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gap43P06837 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gap43P06837 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gap43P06837 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms