Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa4P06798 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxa4P06798 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms