Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Ab1P01921 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Ab1P01921 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
H2-Ab1P01921 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms