Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Dnmt3bO88509 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dnmt3bO88509 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnmt3bO88509 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms