Protein–RNA interactions for Protein: O35308

Slc16a8, Monocarboxylate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a8O35308 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc16a8O35308 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc16a8O35308 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc16a8O35308 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc16a8O35308 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Slc16a8O35308 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc16a8O35308 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc16a8O35308 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc16a8O35308 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc16a8O35308 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc16a8O35308 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc16a8O35308 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc16a8O35308 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc16a8O35308 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc16a8O35308 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc16a8O35308 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms