Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PrkcshO08795 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrkcshO08795 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrkcshO08795 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms