Protein–RNA interactions for Protein: O08746

Matn2, Matrilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn2O08746 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Matn2O08746 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Matn2O08746 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Matn2O08746 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Matn2O08746 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Matn2O08746 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Matn2O08746 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Matn2O08746 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matn2O08746 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matn2O08746 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matn2O08746 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matn2O08746 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matn2O08746 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Matn2O08746 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Matn2O08746 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Matn2O08746 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Matn2O08746 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Matn2O08746 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Matn2O08746 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Matn2O08746 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Matn2O08746 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Matn2O08746 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Matn2O08746 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms