Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm9972E9Q053 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms