Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930558K02RikE0CXC6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930558K02RikE0CXC6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms