Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Spocd1B1ASB6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Spocd1B1ASB6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms