Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms