Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gria4Q9Z2W8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria4Q9Z2W8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms