Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms