Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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