Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms