Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Mbd1Q9Z2E2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Mbd1Q9Z2E2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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