Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms