Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms