Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip6Q9Z1Y4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip6Q9Z1Y4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms