Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms