Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms