Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Setbp1Q9Z180 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setbp1Q9Z180 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms