Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Sumo3Q9Z172 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Sumo3Q9Z172 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Sumo3Q9Z172 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Sumo3Q9Z172 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Sumo3Q9Z172 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Sumo3Q9Z172 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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Sumo3Q9Z172 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Sumo3Q9Z172 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Sumo3Q9Z172 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Sumo3Q9Z172 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Sumo3Q9Z172 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Sumo3Q9Z172 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Sumo3Q9Z172 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Sumo3Q9Z172 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Sumo3Q9Z172 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms