Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms