Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PapolbQ9WVP6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms