Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clcn5Q9WVD4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms