Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms