Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lemd3Q9WU40 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lemd3Q9WU40 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms