Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PplQ9R269 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PplQ9R269 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PplQ9R269 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PplQ9R269 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PplQ9R269 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PplQ9R269 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms