Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms