Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed2Q9R0Q3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms