Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms