Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamc3Q9R0B6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms