Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

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Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sh2d3cQ9QZS8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Sh2d3cQ9QZS8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Sh2d3cQ9QZS8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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